Учитывая, что у нас уже подготовлены разные файлы ответов winn*.sif, логично использовать данный метод. Все что требуется, это включить в каждый файл ответов секцию GuiRunOnce и указать в ней путь к пакетному файлу с командами на установку ПО. Иными словами в winn1.sif у вас должно быть
[GuiRunOnce]
%systemdrive%\Install\batch_file1.cmd
и соответственно в winn2.sif должно быть
[GuiRunOnce]
%systemdrive%\Install\batch_file2.cmd
В этом примере предполагается, что вы поместили пакетные файлы в директорию $OEM$\$1\Install, и они были успешно скопированы на жесткий диск во время текстового этапа установки Windows.